余氯根據聯氨形式和消毒活性分為游離余氯和化合余氯。
游離余氯: 也稱自由氯水溶液中的Cl2,HOC鐵l,OCl-統等為游離余氯，是水中殺毒效果較好，氧化性較強的一種余氯成份，衛生消毒或游泳池水質控制時一般用游離余氯來衡量水質余氯是否達標。
化合余氯：當水中有銨（胺，氨）存在時，氯會同銨反應，生產氯胺（一氯胺、二氯胺、三氯胺）。氯胺的殺菌效果遠弱于次氯酸，而且具有異味。在游泳池中是不受歡迎的成份。但由于氯胺的穩定性要遠強于游離余氯，在以實現長效殺菌作總氯用，所以在自來水供水系統中有一定氯胺是有積極作用的。
游離余氯和化合余氯總稱為總余氯。