1、采樣時間和采樣頻率的確定：執行有規律的水樣采集，即每年應在奉水期和枯水期分別采樣測定，有條件的地方也可以按照地區特點分四季采樣。而那些已經建立了長期觀測點的地方則可按月進行水質監測。從采樣頻率上看，通常每一個采樣期至少采樣監測1次。專門針對飲用水源監測時，就要提高水質監測的頻率，做到每一個采樣期采樣監測兩次，其間隔至少10天。對發現有異常情況時，更應當適當增加采樣監測次數。
2、對水體監測點的穩定布設：以河流水質監測為例，在使用全自動水質檢測儀對水質檢測時，水質采樣應該以哪個采樣點的設水質檢測儀置為監測基準呢?一般來說，應根據河流的寬度和深度而定，水面寬50米以下，只設一條垂線 ，水面寬50至100米 ，設左、右兩條垂線，而當水面寬在多參數水質檢測儀100至1000米時，應設左中右三條垂線，水面寬大于1500米時至少應設5條等距離的垂線。確定好了監測基準就可以將采樣點設置在水面下0.2到0.5米處就可以了。在同樣對于較大較深的采樣水體，因此，采樣點的除了考慮平面位置之外，還有必要在垂線上布點。