氨氮超標處理方法常分為兩類：化學法處理和生物法處理
化學法處理包括：①吹脫法，利用氨氮在水中的平衡關系，調節pH到堿性，使得氨氮以非離子態存NH3-N存在，最后利用空氣把其吹脫出來。
②折點加氯法，利用氨氮和氯反應最終生成氮氣從水中脫除。氯的投加量依照加氯曲線。
③離子交換法，一般選用陽離子交換樹脂。
生物處理法就是我們常說的生物脫氮，主要包括氨化、硝化、反硝化最終以氮氣從水中脫出。生物脫氮現在又很多成熟的工藝，在水處理中非常常見。

此前有媒體報道：“氨氮超標在微生物作用下，氨氮可分解成亞硝酸鹽氮，最終成為硝酸鹽氮。當水中的亞硝酸鹽氮過高時，會和蛋白質結合形成強致癌物質亞硝胺。”
“我在很多場合說過很多次了，還是有些人這樣誤讀。”甘日華說，氨氮首先會生成的是亞硝酸鹽氮，然后有可能生成硝酸鹽，在硝酸鹽濃度達到較高時，硝酸鹽可能引起嬰兒高鐵血紅蛋白血癥。
而亞硝酸鹽氮濃度“過高”的概念，是最少要達到常規水質濃度的1萬倍。“正是因為這個非常高的濃度在自來水里面不可能出現，所以我們當初沒有把亞硝酸鹽氮作為參考指標。”甘日華說。
106項指標并非一項都不能超標
甘日華解釋，106項指標分為微生物、毒理學、感官性狀、一般化學和放射性指標。感觀性狀指標，如濁度，在某種情況下甚至允許適當放寬。部分化學指標，一定條件下也允許在一定范圍內超標，氨氮就屬于一般化學指標范疇。直接關系到健康的是毒理學指標，任何情況下都不允許超標，部分微生物指標也不允許超標。

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