但是在實際應用中面臨著如網絡資源匱乏等難題。中國水資源分布分散二廣闊，要想建立廣覆蓋、大面積的水利監控網，將是一筆投資巨大的工程。與此同時，高清視頻帶來的網絡使用費也是不小的開支。

另一方面就是水利安防環境帶來的工程復雜性與設備高要求，包括取電、防雷、防高低溫、防水、防銹、防盜等，這些因素會增加系統建設與維護成本;再者，從水利部門的建設規劃意圖，是希望建立全流域、全水系的水資源監管監測體系，因此需要信息互通、共享，但目前很多建設現狀還是分散建設，廠家林立，缺乏標準化，導致在區縣到地市、地市到省水利廳、省廳到流域委員會各環節存在互聯互通的瓶頸，造成在大量投資后，卻出現省防辦領導看不到省內某個水庫畫面的情況。

當然，智能水利并非遙不可及。在高新興陳剛看來，未來幾年，網絡建設的加強和物聯網技術的發展(如WSN與MANET)將在很大程度上推動水利安防的應用規模，3G廣域網與WSN局域網結合將豐富水利物聯網的應用。另外，監控系統的互聯互通會成為水利部門重點推進的工作，且作為新建系統的規范要求。水情監測的數據監控與水利安防的視頻監控應用將進一步融合，并與水利業務系統進行集成。